دانلود مقاله انگلیسی رایگان:کشف نقوش RNA پروتئین اتصال با یک مدل تولیدی از توالی RNA - 2020
تبریک 1399
دانلود مقاله انگلیسی داده های بزرگ رایگان
  • Discovering protein-binding RNA motifs with a generative model of RNA sequences Discovering protein-binding RNA motifs with a generative model of RNA sequences
    Discovering protein-binding RNA motifs with a generative model of RNA sequences

    سال انتشار:

    2020


    عنوان انگلیسی مقاله:

    Discovering protein-binding RNA motifs with a generative model of RNA sequences


    ترجمه فارسی عنوان مقاله:

    کشف نقوش RNA پروتئین اتصال با یک مدل تولیدی از توالی RNA


    منبع:

    Sciencedirect - Elsevier - Computational Biology and Chemistry, 84 (2020) 107171: doi:10:1016/j:compbiolchem:2019:107171


    نویسنده:

    Byungkyu Park, Kyungsook Han*


    چکیده انگلیسی:

    Recent advances in high-throughput experimental technologies have generated a huge amount of data on interactions between proteins and nucleic acids. Motivated by the big experimental data, several computational methods have been developed either to predict binding sites in a sequence or to determine if an interaction exists between protein and nucleic acid sequences. However, most of the methods cannot be used to discover new nucleic acid sequences that bind to a target protein because they are classifiers rather than generators. In this paper we propose a generative model for constructing protein-binding RNA sequences and motifs using a long short-term memory (LSTM) neural network. Testing the model for several target proteins showed that RNA sequences generated by the model have high binding affinity and specificity for their target proteins and that the protein-binding motifs derived from the generated RNA sequences are comparable to the motifs from experimentally validated protein-binding RNA sequences. The results are promising and we believe this approach will help design more efficient in vitro or in vivo experiments by suggesting potential RNA aptamers for a target protein
    Keywords: Protein-RNA interaction | Binding motif | Generator | Long short-term memory network


    سطح: متوسط
    تعداد صفحات فایل pdf انگلیسی: 9
    حجم فایل: 1853 کیلوبایت

    قیمت: رایگان


    توضیحات اضافی:




اگر این مقاله را پسندیدید آن را در شبکه های اجتماعی به اشتراک بگذارید (برای به اشتراک گذاری بر روی ایکن های زیر کلیک کنید)

تعداد نظرات : 0

الزامی
الزامی
الزامی
rss مقالات ترجمه شده rss مقالات انگلیسی rss کتاب های انگلیسی rss مقالات آموزشی
logo-samandehi