دانلود و نمایش مقالات مرتبط با کمپلکس های زیست-مولکولی::صفحه 1
بلافاصله پس از پرداخت دانلود کنید

با سلام خدمت کاربران در صورتی که با خطای سیستم پرداخت بانکی مواجه شدید از طریق کارت به کارت (6037997535328901 بانک ملی ناصر خنجری ) مقاله خود را دریافت کنید (تا مشکل رفع گردد). 

نتیجه جستجو - کمپلکس های زیست-مولکولی

تعداد مقالات یافته شده: 1
ردیف عنوان نوع
1 برازش سریع و حساس جسم صلب در نقشه های تراکم میکروسکوپ الکترونی کرایو (cryo-EM) به کمک نرم افزار PowerFit
سال انتشار: 2015 - تعداد صفحات فایل pdf انگلیسی: 15 - تعداد صفحات فایل doc فارسی: 24
Cryo-EM یک روش به سرعت در حال توسعه برای بررسی ساختار سه بعدی کمپلکس های ماکرومولکولی است. با وجود تمام پیشرفت های انجام شده در این زمینه، وضوح اکثر نقشه های تراکم Cryo-EM برای ساخت مدلی نو بسیار کم است. بنابراین، داده ها اغلب با برازش تراکم زیرواحدهایی با وضوح بالا برای تفسیر اتمی تکمیل می شوند. در حالت طبیعی اولین مرحله در فرآیند مدل سازی، قرار دادن زیرواحدها در تراکمی به عنوان یک جسم صلب است. یک روش عینی برای این قرارگیری خودکار، جستجوی همبستگی متقابل شش بعدی کاملاً جامع بین مدل و داده های Cryo-EM است که در آن سه درجه آزادی انتقالی و سه درجه آزادی دورانی به طور سیستماتیک نمونه گیری می شوند. در این مقاله نرم افزار PowerFit را ارائه می دهیم که یک بسته و برنامه نرم افزاری پایتون Python)) برای نصب سریع و حساس جسم صلب است. یک تابع امتیازدهی حساس تر و جدید به نام همبستگی متقابل محلی هسته ای را معرفی می کنیم و نشان می دهیم که چگونه می توان مقدار آن را با استفاده از تبدیل های فوریه سریع (FFTs) مربوط به اسکن های همبستگی متقابل انتقالی سریع محاسبه کرد. یک الگوریتم جستجو را نیز با استفاده از مجموعه های دورانی بهینه شده برای کاهش افزونگی دورانی و با محدود کردن اندازه داده های Cryo-EM از طریق نمونه برداری مجدد و اصلاح تراکم بهبود بخشیدیم. ما حساسیت امتیازدهی برتر تابع امتیازدهی خود را بر روی داده های شبیه سازی شده از ریبوزوم 80S D. melanogaster و داده های تجربی برای چهار مورد مختلف نشان می دهیم. از طریق این پیشرفت ها، اکنون می توان جستجوی دورانی ریزبافتی در عرض چند دقیقه بر روی CPU و در عرض چند ثانیه بر روی GPU انجام داد. نرم افزار PowerFit یک نرم افزار رایگان است و می توانید آن را از سایت https://github.com/haddocking/powerfit دانلود کنید.
کلیدواژه ها: همبستگی متقابل | جستجوی جامع | شتاب دهنده GPU | تبدیل فوریه سریع (FFT) | مجموعه های دورانی بهینه شده | اصلاح | نمونه برداری مجدد | کمپلکس های زیست-مولکولی
مقاله ترجمه شده
rss مقالات ترجمه شده rss مقالات انگلیسی rss کتاب های انگلیسی rss مقالات آموزشی
logo-samandehi
بازدید امروز: 4370 :::::::: بازدید دیروز: 0 :::::::: بازدید کل: 4370 :::::::: افراد آنلاین: 63